Органы управления Фонда:
Совет Фонда
Президент Фонда
Попечительский Совет фонда
Совет Фонда решает вопросы общего руководства деятельностью Фонда.
Совет Фонда включает 7 человек: члены администрации школы и педагоги МЭШ. Состав Совета избирается согласно Уставу Фонда сроком на три года и утверждается на заседании Совета Фонда простым большинством голосов.
Президент Фонда осуществляет ежедневное руководство деятельностью Фонда.
Президент избирается Советом фонда сроком на три года.
Президент Фонда - Кравченко Наталья Викторовна - родитель студента МЭШ.
Попечительский Совет Фонда состоит из 19 человек: педагоги и родители студентов МЭШ. Попечительский Совет осуществляет контроль деятельности Фонда и использования его средств. Формируется Советом Фонда сроком на три года.